Sobre a companhia

Desmond, Lucy e Vidic no laboratório, dentro da Abstergo.

Vidic diz que a companhia é responsável por todos os avanços científicos do ultimos 1000 anos, também dizendo que empresa escolhe quem vai levar o crédito com muito cuidado.
Mais tarde, enquanto estava sendo mantido dentro do laboratório, Desmond descobre que eles são uma versão moderna dos Cavaleiros Templários. E também, no e-mail da sala de conferencia, Alan Rikkin escreve para Vidic: "Que o Pai do Entendimento o guie até o sucesso", que seria uma espécie de saudação padrão entre eles, assim como o "Nada é verdade e tudo é permitido" dos Assassinos. Quando Desmond pergunta quem realmente tinha inventado toda a tecnologia dos ultimos 1000 anos Vidic simplesmente reponde que foram "Os Que Vieram Antes".
Abstergo também está caçando os ultimos Assassinos restantes no mundo, esperando acabar com o modo de vida de seu inimigo e também eliminando qualquer chance de falha em seu plano de estabelecer a "Nova Ordem Mundial".
Se o jogador consegue ter acesso aos e-mails de Vidic, eles podem ler que o Acidente com um meteoro em Tunguska foi na verdade, um ataque feito por Assassinos em uma base da empresa na Russia. O e-mail também discreve sobre o Incidente Philadelphia, no qual o Navio da Marinha Americana Eldrige (Que estava estacionado no Estaleiro Naval da Philadelphia) foi feito invisível durante varios segundos, e mandado para frente no tempo. Qualquer experiencias relacionadas ao artefato que conseguia controlar e/ou manipular o tempo foram desativadas, com Abstergo citando possíveis problemas com Paradoxos. No mesmo e-mail Rikkin comenta sobre Os Comunicadores de Mitchel-Hedges, no qual é uma referência abstrata à 13 Caveiras de Cristal Incas, supostamente descobertas pelo aventureiro Mitchel Hedges em 1920. Os teoristas dizem que as Caveiras permitem comunicação telepática entre seus portadores, e portanto, o termo 'comunicadores' usado no e-mail indica que Abstergo tem essas caveiras, é capaz de usá-las, com membros de alto escalão se comunicando, e também é mencionado do e-mail que os Assassinos Modernos não podem detectar essa comunicação.
Através dos e-mails também descobrimos que Abstergo está sendo investigada, pelo teste de um novo medicamento e/ou componente químico, chamado de "O novo Fluoreto", o qual eles testaram em uma comunidade isolada, foram pegos, e estão agora sob investigação. Essa é a razão pelo lançamento de seu satélite em 21/12/2012. Eles adiam o lançamento porque, com a investigação, eles correm o perigo de suas operações serem congeladas. O lançamento do dia 21 de Dezembro de 2012 também é uma data significante, não somente pelo lançamento do satélite, mas também pelo motivo de ser o final do 12º Baktun, que no calendário Maya seria o 'fim do mundo ao qual conhecemos' e o início do 13º Baktun, que é mencionando nas Mensagens Ocultas contidas no laboratório que são representadas como '13.0.0.0' e também as palavras em Árabe significando "Terremoto" ou "O Terremoto", também temos palavras em Hebreu que dizem "O Mundo que Virá", e todas possívelmente nos levam devolta ao suposto 'fim do mundo' em 21 de Dezembro de 2012.
Lucy também menciona o Incidente com o Satélite no A.I.D depois que Desmond a ouve falando no telefone com Vidic: "Estamos em Denver", que seria um termo, para tembém se dizer "Está tudo bem". Ela possivelmente usou esse termo para ter a oportunidade de explicar sobre o incidente, dando assim, uma margem maior de conhecimento sobre a Abstergo para Desmond. Ela explica que o acidente aconteceu em baixo do Aeroporto Internacional de Denver, ou A.I.D (Em ingles a sigla seria D.I.A, Denver International Airport) aonde está localizada uma base secreta da Abstergo e uma Piece of Eden foi possívelmente destruída no acidente, no caso a Piece nº 2, A Maçã, e que as mortes passaram de 20. Nos e-mails no qual Lucy falou com os Assassinos, ela diz que aquele seria o possível local do lançamento do Satélite da Abstergo.